Ciudad del Vaticano: Tierra Santa de los católicos. En medio de la tierra, hay una organización que lleva a cabo investigaciones rigurosas sobre "afirmaciones de milagros" de todo el mundo para determinar su credibilidad. La organización se conoce como "Seito no Za" (Asamblea de los Santos) y los sacerdotes que pertenecen allí se llaman investigadores de milagros. Robert Nicholas, un experto en archivos antiguos y criptoanálisis, es socio y es un buen amigo de Hiraga Josef Kou, un genio científico. Juntos, el brillante dúo investiga los "milagros" y descubre los incidentes y conspiraciones que se esconden detrás de ellos.
